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CRISPR位点查询数据库

CRISPR-Cas系统是一种强大的基因编辑工具。CHOPCHOP(https://chopchop.cbu.uib.no/)是一个可以查询基因编辑位点的工具。


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使用


CHOPCHOP数据库支持200多个基因组的查询。同时对于基因编辑的目的来说,这次的版本支持了包括knock-outknock-inactivationrepressionnanopore enrichment四个选择,我们可以根据自己的需要来查找。同时在Options我们还可以自己定义很多东西。


我们这次查找RNF180knock-out


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结果


结果也很简单。首先是包括了一个关于基因位置的信息图和一个可能的靶标序列。同时这个网站还提供了不同类型的下载文件。


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另外点击UCSC genome brower还可以在UCSC浏览器的上查看结果。


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